Bioinformatik

Seit 1998 beschäftige ich mich beruflich mit Bioinformatik, also mit der Analyse, Organisation und Speicherung biologischer Daten (s.a. Wikipedia). In die Bioinformatik wurde in den 1990'er Jahren sehr grosse Erwartungen und sehr viel Geld gesteckt. Zum Teil wurden diese Erwartungen auch erfüllt, z.B. mit der Entschlüsselung des humanen Genoms im Rahmen des Human Genome Project, um nur ein highlight zu nennen. Um die Jahrtausendwende wurden deswegen und wegen dem allgemeinen Biotech-Hype an vielen Universitäten dedizierte Bioinformatik-Studiengänge gegründet. Wirtschaftlich hat sich die Bioinformatik allerdings als nicht sonderlich tragfähig erwiesen, so dass heute der Arbeitsmarkt für Bioinformatiker gesättigt sein dürfte. Nichtsdestotrotz ist die Bioinformatik eine hochinteressante Spezialisierung und erlaubt eine informationstheoretische Auseinandersetzung mit der faszinierenden Welt der Molekularbiologie.

top

Diplomarbeit

Zum erstenmal kam ich mit der Bioinformatik während meiner Diplomarbeit am Ende meines Informatikstudiums in Berührung. Es handelte sich dabei um eine Kooperation zwischen dem Lehrstul für Rechnertechnik und Rechnerorganisation / Parallelrechnerarchitektur und dem Lehrstuhl für Mikrobiologie der Technischen Universität München mit dem etwas umständliche Titel Entwicklung von Heuristiken zum computerunterstützten Alignment ribosomaler RNS-Sequenzen unter Berücksichtigung ihrer Sekundärstruktur. Sie war Teil des ARB Projektes, für das damals bessere globale alignment Algorithmen für die damit verwalteten rRNS-Sequenzen gesucht wurden und ist RechtshierLinks als PDF abrufbar.